昨日の放牧では動画の構成を考えました。雑ですが以下が概略。 GEOトップから、Datasets->"miRNA" で検索 例として使うのはGDS3685 Dicer1欠乏肝臓細胞(Mus musculus)の解析 Dicer1はmiRNAを前駆体からmatureにするのに必要なRNaseIII-type酵素。 Expression…

前回のやり残し。及び訂正。 uncentered correlation coefficientですが、ピアソンの相関係数と違って、yi=axi+b (a>0, b≠0)の形では1になりません。b=0のときのみ1です。 変動の仕方しか見ないピアソンの相関係数、そして変動の仕方は見ないユークリッド距…

今日は主に、データセットブラウザのクラスタ解析ツールについて調べました。クラスタリングのアルゴリズムは、以下の3つから選択できます。これらはいずれも、まず各遺伝子を自身だけからなるクラスタと見なし、以後、クラスタ間の距離が近い、すなわちよく…